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Google sitemaps n'est qu'une aide a l'indexation d'un site.
En aucun cas (du moins pour l'instant) cela aura un effet néfaste sur ton site.
D'après mes tests (ils sont pas encore fini), le google sitemaps ne serait utile que pour les sites déjà indexé... C'est peut être s'avancer un peu mais je continue mes tests.