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Les logiciels de soumission : c'est pas terrible et ne servent à pas grand chose. Les moteurs trouvent tout seul un site s'il existe un lien sur le web et l'inscription dans les annuaires est mieux si manuelle (contrôle et vérification des inscriptions).
Logiciels de suivi : permet de faire le point, d'analyser son ref et d'avoir de jolis rapports pour le fun.
Je ne pense pas qu'un logiciel puisse avoir des conséquences plus grave que le référencement manuel et la sandbox fait certainement partie des risques d'inscriptions massives automatiques ou manuelles.
referencement manuel il n'y a rien de mieux, de plus la plupart des annuaire te demanderons un lien retour, donc si tu fais auto tu mettra pas de lien retour et l'annuaire ne t'ajoutera pas, donc ca sert a rien.