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Est il judicieux (ou pas du tout, ou neutre) de rappeler en pied de page les pages les plus importantes d'un site, afin qu'un lien (même peu qualifié dans le footer) soit présent sur tous le site.
Certains sites Internet de type e-commerce réalisent des liens de ce genre.
Rien ne vous empêche de faire pareil avec votre site Internet.
Ceci ne devrait pas gêner le référencement du site Internet.